HostSeq: la première banque de données génomiques et cliniques en son genre au Canada
HostSeq est la première banque de données génomiques et cliniques en son genre au Canada, dont les données sont consenties pour la recherche en santé. Elle permet ainsi aux chercheurs d’avoir accès à un riche ensemble de données pour les aider à analyser et à identifier les déterminants génétiques de la santé d’un point de vue canadien.
Dirigée par CGEn, plateforme nationale canadienne de séquençage et d’analyse des génomes, HostSeq repose sur les résultats de 16 études de recherche clinique pour séquencer le génome de plus de 10 000 patients canadiens atteints de la COVID-19 et recueillir de l’information clinique sur ceux-ci en vue de comprendre la contribution du génome hôte à la maladie et à d’autres problèmes de santé. Les données de HostSeq sont utilisées à des fins de soutien de la recherche sur le cancer, le trouble du spectre de l’autisme, la santé cardiaque et plus encore.
Description détaillée
Constituée à partir des données consenties pour la recherche en santé par plus de 10 000 participants à 16 études sur la COVID-19 menées partout au pays, la banque de données HostSeq regroupe quelque 10 000 fiches contenant des données cliniques et séquences génomiques complètes, auxquelles elle offre un accès contrôlé. En plus de faciliter la mise en commun des données à l’échelle internationale et d’offrir le couplage avec des ensembles de données administratives, HostSeq permet de caractériser le rôle du génome hôte dans la maladie, de découvrir de nouveaux biomarqueurs pour prédire les risques, de cibler des stratégies de soins et d’enrichir le bassin de talents au Canada.
- Ensemble de données canadien diversifié
- Variants provenant de plus de 10 000 séquences du génome entier
- Données consenties pour la recherche sur la COVID-19 et d'autres domaines de la santé
- Données accessibles aux chercheurs des secteurs public et privé
- Admissibilité de toute recherche approuvée par un comité d'éthique de recherche
- Accès gratuit aux données
Consultez les données agrégées, apprenez-en plus sur les projets qui utilisent actuellement les données de HostSeq (en anglais seulement) et faites une demande d'accès
Le projet HostSeq est issu du Réseau canadien de génomique COVID-19 (RCanGéCO) de Génome Canada, financé par l’intermédiaire du gouvernement fédéral.
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